Jülich: Masterarbeit - Entwicklung einer robusten Protein-Sekretionsstrategie mittels Laborautomatisierung

Unser Institutsbereich Biotechnologie (IBG-1) am Institut für Bio- und Geowissenschaften ist führend in der Bioprozessentwicklung für die industrielle Biotechnologie. In der Arbeitsgruppe Bioprozesse und Bioanalytik setzen wir modernste Automatisierungs- und Digitalisierungstechniken ein, um Bioprozesse zu optimieren. Wir erforschen innovative Ansätze zur Durchmusterung von Stammbibliotheken und zur Entwicklung biotechnologischer Prozesse. Gestalten Sie mit uns aktiv den Wandel in diesem spannenden Bereich!

Ihre Aufgaben:

Die angebotene Masterarbeit ist Teil eines Projektes, dessen Ziel es ist, die Produktion heterologer Proteine nachhaltiger zu machen. Die so produzierten Proteine können zum Beispiel eingesetzt werden, um Lebensmittel sicherer und umweltfreundlicher zu machen, um Mikroplastik zu reduzieren, oder um antibiotikaresistente Keime zu bekämpfen. Für die nachhaltige Produktion dieser Proteine soll deren Sekretion durch den Expressions-Host Corynebacterium glutamicum optimiert werden.

Basierend auf vorangehender Forschung zum Einfluss von Sekretions-Signalpeptiden und Proteinsequenz auf die Sekretionsleistung, soll nun eine generalisierbare Strategie für die Sekretion verschiedener Zielproteine entwickelt werden. Um dieses Ziel zu erreichen, werden Hochdurchsatz-Methoden und hochmoderne Techniken der Laborautomatisierung eingesetzt.
Dieses Projekt ist Teil des Verbundprojekts Bioökonomie-Revier, welches den Strukturwandel im Rheinischen Braunkohlerevier vorantreiben und einen Beitrag zur Transition zu einer nachhaltigen Gesellschaft und Wirtschaftsweise leisten möchte.

Es wird schwerpunktmäßig darum gehen, Einflussfaktoren auf die Sekretionsleistung von Corynebacterium glutamicum zu untersuchen. Ein besonderes Augenmerk wird dabei darauf gelegt, eine Sekretionsstrategie zu entwickeln, die unabhängig vom gewählten Zielprotein zu guten Ergebnissen führt.

Zu Ihren Aufgaben im Rahmen des Projektes werden gehören:

• Molekularbiologische Erstellung von C. glutamicum Sekretionsstammbibliotheken mit Hilfe eines OpenTrons OT-2 Laborroboters
• Kultivierung der Stämme auf einer automatisierten Mikrokultivierungsplattform
• Quantifizierung der Sekretionsleistung mittels splitGFP-Assay und ggf. anderer Methoden
• Vorausschauende Planung von Experimenten unter Einbezug von Literaturrecherche
• Sorgfältige Dokumentation der durchgeführten Arbeiten und selbstständige Datenauswertung mit Python und MS Excel
• Präsentation der Arbeitsergebnisse in gruppeninternen Seminaren

Das Projekt soll einen Zeitraum von mindestens fünf Monaten umfassen.

Ihr Profil:

• Sie studieren Biologie, Biotechnologie, Molekularbiologie oder eine verwandte Disziplin im Masterstudiengang
• Sie konnten bereits Erfahrungen bei der Arbeit im Labor sammeln, z.B. bei Praktika oder Abschlussarbeit
• Sie sind bereit, sich in neue Methoden (z. B. Klonierung, Kultivierung, Datenanalyse) und grundlegende Programmierung (Python) einzuarbeiten und/oder bringen bereits Vorkenntnisse in diesen Bereichen mit
• Sie sind interessiert am Einsatz von Hochdurchsatz-Methoden im Labor und an der Optimierung biotechnologischer Prozesse
• Sie besitzen ein hohes Maß an Selbstständigkeit, Motivation und Zuverlässigkeit
• Sie zeigen eine sehr strukturierte, proaktive und ordentliche Arbeitsweise

Unser Angebot:

Unser Institutsbereich Biotechnologie (IBG-1) am Institut für Bio- und Geowissenschaften ist führend in der Bioprozessentwicklung für die industrielle Biotechnologie. In der Arbeitsgruppe Bioprozesse und Bioanalytik setzen wir modernste Automatisierungs- und Digitalisierungstechniken ein, um Bioprozesse zu optimieren. Wir erforschen innovative Ansätze zur Durchmusterung von Stammbibliotheken und zur Entwicklung biotechnologischer Prozesse.
Gestalten Sie mit uns aktiv den Wandel in diesem spannenden Bereich!

Wir bieten Ihnen:

• SINNSTIFTENDE AUFGABEN: Ihre Abschlussarbeit behandelt ein zukunftsorientiertes, gesellschaftlich relevantes Thema mit unmittelbarem Praxisbezug in einem internationalen Umfeld
• WISSENSCHAFTLICHES UMFELD: Sie erwartet eine exzellente wissenschaftliche Ausstattung, moderne Technologien und eine qualifizierte Betreuung durch erfahrene Kolleg:innen
• PRAXISNÄHE: Bei uns sammeln Sie wertvolle Praxiserfahrungen neben dem Studium und wirken aktiv an interdisziplinären Projekten mit
• INTERNATIONALES TEAM: Erleben Sie ein angenehmes, kollegiales Arbeitsumfeld in einer der renommiertesten Forschungseinrichtungen Europas
• FAIRE VERGÜTUNG: Ihre Abschlussarbeit wird bei uns angemessen vergütet
• EIGENVERANTWORTUNG: Sie gestalten Ihre Aufgaben eigenständig – von der Vorbereitung bis zur Durchführung
• WORK-LIFE-BALANCE: Optimale Bedingungen für die Vereinbarkeit von Beruf und Privatleben sowie eine familienfreundliche Unternehmenspolitik. Die Möglichkeit zum (orts-)flexiblen Arbeiten nach Abstimmung und im Einklang mit den anstehenden Aufgaben und (Vorort-)Terminen ist gegeben, z. B. teilweise im Homeoffice
• PRAKTIKUM MÖGLICH: Gerne bieten wir die Möglichkeit, der Masterarbeit ein Praktikum voranzustellen. So können Sie sich frühzeitig in das Thema einarbeiten und eine fundierte Basis für eine erfolgreiche Abschlussarbeit schaffen.

Neben spannenden Aufgaben und einem kollegialen Miteinander bieten wir dir noch viel mehr: https://go.fzj.de/Benefits

Wir freuen uns über Bewerbungen von Menschen mit vielfältigen Hintergründen, z.B. hinsichtlich Alter, Geschlecht, Behinderung, sexueller Orientierung / Identität sowie sozialer, ethnischer und religiöser Herkunft. Ein chancengerechtes, diverses und inklusives Arbeitsumfeld, in dem alle deine Potentiale verwirklichen können, ist uns wichtig.

Über die folgenden Links findest du weitere nformationen zu Vielfalt und Chancengerechtigkeit: https://go.fzj.de/diversitaet sowie zur gezielten Förderung von Frauen: https://go.fzj.de/job-journey-women